55 पेपर
यह शोध पत्र ADAR-Sense को प्रस्तुत करता है, जो एक उपयोगकर्ता-अनुकूलन योग्य, ओपन-एक्सेस वेब टूल है जो विभिन्न अनुसंधान और अनुवादात्मक अनुप्रयोगों में सटीक, कोशिका-लक्षित जैव प्रौद्योगिकी हस्तक्षेपों को सुगम बनाने के लिए प्रजाति-तटस्थ (species-agnostic) ADAR-आधारित RNA सेंसर (sesRNA) के डिज़ाइन को स्वचालित करता है।
यह अध्ययन एरिलामाइन एन-एसिटाइलट्रांसफेरेज़ (arylamine N-acetyltransferases) के एक नवीन वर्ग की पहचान करता है जो पॉलीकेटाइड श्रृंखलाओं के बीच एक अभिसारी अमिडेटिव कंडेनसेशन (convergent amidative condensation) को उत्प्रेरित करते हैं, जो जटिल एमाइड-लिंक्ड पॉलीकेटाइड्स के संयोजन संबंधी जैव-संश्लेषण (combinatorial biosynthesis) के लिए एक नया प्रतिमान स्थापित करता है और विविध गैर-प्राकृतिक उपचारात्मकों (non-natural therapeutics) के सृजन को सक्षम बनाता है।
यह अध्ययन एक नवीन स्प्लिट-जीएफपी (split-GFP) और सीआरआईएसपीआरआई (CRISPRi) दृष्टिकोण का उपयोग करके *Synechocystis* sp. PCC 6803 में 103 हेटरोलॉगस एंजाइमों के क्षरण को व्यवस्थित रूप से परिमाणित करता है, जो यह प्रकट करता है कि इनमें से लगभग आधे प्रोटीन महत्वपूर्ण रूप से क्षरित होते हैं और यह प्रदर्शित करता है कि साइनोबैक्टीरियल सेल फैक्ट्रियों में अभिव्यक्ति में सुधार के लिए आनुवंशिक तत्वों को अनुकूलित करने की तुलना में एंजाइमों को होमोलॉग्स (homologs) के साथ बदलना अक्सर अधिक प्रभावी होता है।
यह शोध पत्र SIRIUS को प्रस्तुत करता है, जो एक कॉम्बिनेटरियल ऑप्टिमाइज़ेशन एल्गोरिदम है जो होस्ट-विशिष्ट कोडोन उपयोग बाधाओं का पालन करते हुए, एक दिए गए प्रोटीन के लिए अधिकतम विचलित (divergent) डीएनए अनुक्रम उत्पन्न करने के लिए इंटीजर लीनियर प्रोग्रामिंग का उपयोग करता है, जिससे यह सिंथेटिक स्ट्रेन स्थिरता को बढ़ाने के लिए साझा उप-अनुक्रमों (subsequences) को न्यूनतम करने में मौजूदा ह्यूरिस्टिक और मशीन लर्निंग विधियों से बेहतर प्रदर्शन करता है।
यह शोध पत्र एक स्वचालित वर्कफ़्लो प्रस्तुत करता है जो पबमेड (PubMed) साहित्य से CAR T सेल सिग्नलिंग इंटरैक्शन का एक व्यापक नॉलेज ग्राफ बनाने के लिए एनएलपी (NLP) उपकरणों और लार्ज लैंग्वेज मॉडल्स को एकीकृत करता है, जिससे अगली पीढ़ी के काइमेरिक एंटीजन रिसेप्टर्स के डिज़ाइन को निर्देशित करने के लिए एक संरचित संसाधन प्रदान किया जा सके।
यह अध्ययन डीएनए ओरिगामी नैनोस्ट्रक्चर के भीतर व्यक्तिगत लिगेशन प्रतिक्रियाओं का वैश्विक स्तर पर विश्लेषण करने के लिए क्वांटिटेटिव पीसीआर (qPCR) का उपयोग करता है, जो यह प्रकट करता है कि लिगेशन दक्षता किनारों बनाम आंतरिक स्थलों पर लाइगेज डॉकिंग संभावना पर स्थानिक रूप से निर्भर है, एक ऐसा रुझान जिसे DMSO सह-विलायक द्वारा समाप्त किया जा सकता है, जिससे वास्तविक दुनिया के अनुप्रयोगों के लिए डीएनए नैनोस्ट्रक्चर की स्थिरता को अनुकूलित करने के लिए महत्वपूर्ण अंतर्दृष्टि प्राप्त होती है।
यह शोध पत्र एक बहु-स्तरीय गणितीय मॉडल विकसित करता है और कैंसर उपचार के लिए चिकित्सीय गतिविधि के गतिशील ट्यूनिंग को सक्षम करने वाले प्रमुख इंजीनियरिंग लक्ष्यों, जैसे कि लिगैंड जुड़ाव दर और प्रमोटर शक्ति, की पहचान करने के लिए synNotch-CAR T-कोशिकाओं पर वैश्विक संवेदनशीलता विश्लेषण करता है।
यह शोध पत्र कोलोराडो स्टेट यूनिवर्सिटी में विकसित एक कोर्स-आधारित स्नातक अनुसंधान अनुभव (CURE) प्रस्तुत करता है जो गाइड आरएनए (gRNA) प्रभावकारिता की तीव्र, वायरल-आधारित स्क्रीनिंग का उपयोग करता है ताकि पादप रूपांतरण (plant transformation) की लंबी समयावधि को दूर किया जा सके, जिससे स्नातक छात्र *एराबिडोप्सिस थैलियाना* (*Arabidopsis thaliana*) में जीन अभिव्यक्ति के सिंथेटिक विनियमन के लिए सफलतापूर्वक gRNAs को डिजाइन और मान्य करने में सक्षम हो सकें।
अल्फाफोल्ड प्रोटीन स्ट्रक्चर डेटाबेस का विस्तार लगभग 4,800 प्रोटिओमों में 1.8 मिलियन उच्च-विश्वास वाले प्रोटीन परिसरों को शामिल करने के लिए किया गया है, जो आणविक अंतःक्रियाओं को समझने और जीव विज्ञान में कार्यात्मक खोज को सुगम बनाने के लिए एक आधारभूत संसाधन प्रदान करता है।
यह शोध पत्र प्रत्यक्ष कार्बोडाइमाइड कपलिंग के माध्यम से कार्यात्मक परफ्लोरोपॉलीईथर फ्लोरोसरफैक्टेंट्स के संश्लेषण के लिए एक त्वरित, जीव विज्ञान-प्रयोगशाला-अनुकूल विधि प्रस्तुत करता है, जो अनुकूलित सरफैक्टेंट्स के इन-हाउस उत्पादन को सक्षम बनाता है जो जीनोमिक स्क्रीनिंग, थर्मोसाइक्लिंग और प्रोटीन क्रिस्टलीकरण जैसे विविध ड्रॉपलेट माइक्रोफ्लुइडिक अनुप्रयोगों का समर्थन करते हैं।